Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb1P09055 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itgb1P09055 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms