Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TnfP06804 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TnfP06804 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms