Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms