Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PdgfrbP05622 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PdgfrbP05622 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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