Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04214 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P04214 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04214 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04214 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04214 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04214 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04214 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04214 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms