Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxa7P02830 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms