Protein–RNA interactions for Protein: P01819

Ig heavy chain V region MOPC 141, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01819 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01819 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01819 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01819 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P01819 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01819 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01819 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01819 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01819 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms