Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01740 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01740 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01740 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01740 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01740 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01740 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01740 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01740 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01740 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01740 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms