Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ComtO88587 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ComtO88587 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ComtO88587 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ComtO88587 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ComtO88587 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ComtO88587 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ComtO88587 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ComtO88587 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ComtO88587 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ComtO88587 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ComtO88587 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ComtO88587 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms