Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Shoc2O88520 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shoc2O88520 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shoc2O88520 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shoc2O88520 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shoc2O88520 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shoc2O88520 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shoc2O88520 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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