Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Dnmt3bO88509 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dnmt3bO88509 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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