Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms