Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AvilO88398 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AvilO88398 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AvilO88398 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AvilO88398 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AvilO88398 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AvilO88398 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms