Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tnnt1O88346 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnnt1O88346 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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