Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Col5a1O88207 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Col5a1O88207 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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