Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mid1O70583 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms