Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tspan6O70401 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms