Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Top3aO70157 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Top3aO70157 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Top3aO70157 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Top3aO70157 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Top3aO70157 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3aO70157 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Top3aO70157 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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