Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Ldb2O55203 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ldb2O55203 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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