Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx4O55187 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cbx4O55187 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cbx4O55187 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cbx4O55187 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cbx4O55187 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms