Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc3O55013 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms