Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn5O54942 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn5O54942 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn5O54942 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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