Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChkaO54804 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChkaO54804 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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