Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Bnc1O35914 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bnc1O35914 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms