Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Emp3O35912 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Emp3O35912 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms