Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cited2O35740 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms