Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf9O35739 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms