Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Edil3O35474 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms