Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 405.9 ms