Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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