Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Kcnk3O35111 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Kcnk3O35111 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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