Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kif3cO35066 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kif3cO35066 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms