Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn4O35054 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms