Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EllO08856 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EllO08856 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EllO08856 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
EllO08856 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
EllO08856 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
EllO08856 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EllO08856 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
EllO08856 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EllO08856 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EllO08856 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EllO08856 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
EllO08856 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EllO08856 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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