Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Eftud2O08810 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms