Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Casp6O08738 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Casp6O08738 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Casp6O08738 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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