Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MttpO08601 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MttpO08601 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MttpO08601 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms