Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec22bO08547 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms