Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MsmbO08540 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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