Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp35M0QWN7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp35M0QWN7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms