Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm6871L7N248 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm6871L7N248 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm6871L7N248 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm6871L7N248 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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