Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm3542K7N6U2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm3542K7N6U2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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