Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3402K7N5P2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms