Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
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Gm21887J3QQ04 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Gm21887J3QQ04 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
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