Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm2056J3QQ02 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm2056J3QQ02 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms