Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccer2J3QPU5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms