Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm5225J3QPL3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Gm5225J3QPL3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm5225J3QPL3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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