Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm20918J3QN17 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm20918J3QN17 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm20918J3QN17 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm20918J3QN17 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20918J3QN17 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Gm20918J3QN17 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20918J3QN17 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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