Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20830J3KML6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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