Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20828J3KMI7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20828J3KMI7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms